Der 14-jährige Sora lebt mit seinen besten Freunden Riku und Kairi auf der Insel des Schicksals. Die Drei wollen mit einem selbst gebauten Floß in See stechen um andere Inseln zu entdecken, jedoch kommt es nicht dazu, da die Insel in der Nacht zuvor von seltsamen Kreaturen heimgesucht und die drei Freunde von der Finsternis verschlungen und getrennt werden.
In Soras Händen materialisiert sich eine ungewöhnliche Waffe, das Schlüsselschwert. Nach einem Kampf gegen einige Kreaturen findet sich Sora in einer ihm unbekannten Welt wieder. Er trifft dort auf Donald und Goofy, welche auf der Suche nach ihm, dem Träger des Schlüsselschwertes, sind um ihren König wieder zu finden. So schließen sich die Drei zusammen und beginnen Ihre abenteuerliche Reise zu unterschiedlichen Welten, welche aus diversen Disney-Filmen stammen, auf der Suche nach Kairi, Riku und dem König.